3. 还丹第三 找到了药，下一步就是炼制。“还”字是关键，即返还、回归之意。还丹，就是通过特定方法，将后天分离的阴阳能量（坎离）返还为先天一体的纯阳状态（乾）。这个过程如同将矿石炼成纯金。初步炼成的称为“小还丹”，主要指心肾相交，精气初步融合产生的能量结晶，能祛病健体。更进一步，大药过关，贯通任督，完成小周天循环，体内阴阳全面调和，称为“大还丹”，是质变的开始。还丹的过程，就是生命能量的提纯和升华。

4. 文武第四 这是控制火候的方法。火，并非有形之火，而是人的意念、神意。用神意调节呼吸与能量的运行，其强度和方式称为“火候”。“文火”是指柔和、温煦、似守非守的意念，如同小火慢炖，用于温养、沐浴阶段。“武火”是指强烈、专注、提聚的意念，如同猛火烹炼，用于采药、运河车等关键冲刺阶段。文武火候的运用，是炼丹成败的关键，需灵活掌握，时机不对，或过强过弱，都可能前功尽弃。这需要老师在旁指点，或修炼者自己细心体悟。

5. 神运第五 神，指元神；运，指运行、运动。当修炼到一定程度，体内真气充沛，就不再仅仅依靠后天意念（识神）去引导，而是会出现一种“真气自行”的现象，仿佛有一股更高级的力量（元神）在自动运转周天，循经络流注。此时，修炼者应进入“勿忘勿助”的状态，即不忘记观照，也不强行干预，只是静观其变，顺其自然。这种“神运”是能量高度自动化运行的标志，比有意引导更为精准、高效，符合天道自然的法则。

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6. 黄芽第六 这是一个非常形象的比喻。在内丹过程中，当神气交融、水火既济达到一定程度，丹田（主要是下丹田）会产生一种温暖、融融、生机勃勃的景象，仿佛大地回春，土中冒出嫩黄的芽苗。这“黄芽”便是大药初生的征兆，是先天一气萌动的体现。它代表生命新的生机已被唤醒，是炼丹的宝贵成果和希望所在。它不是有形之物，而是一种内在的生机体验和能量感。

7. 白汞第七 汞，在外丹术中指水银，特性活泼流动，遇热易飞散。在内丹中，“白汞”喻指人的元神、心神。常人的心神易动，念头如汞珠般流转不定，容易外驰散逸。修炼就是要收摄这“白汞”，使其凝定、purified（纯净）。通过凝神入气穴（如丹田），使纷飞的心神（白汞）沉静下来，与元气（铅）相结合，神气抱一，则汞性不飞，反成炼丹之主宰。

8. 金虎第八 与“白汞”相对，“金虎”喻指人体之元精、真情。金，表示其珍贵和坚固；虎，表示其能量威猛但难以驯服。元精易随情欲而耗损，如虎奔突。修炼者须“擒白虎”，即通过炼精化气的方法，固精保元，将这股强大的生命能量转化升华，使其如真金般坚固不坏，为我所用。金虎（元精）与白汞（元神）的交合，是金丹凝结的核心。

9. 玄曜第九 玄，幽深微妙；曜，光明照耀。“玄曜”指的是内丹修炼中出现的各种光感景象。当修炼者进入甚深静定，神气高度凝聚时，体内可能会产生“阳光三现”等光明内景，或于虚室中见种种光华。这并非是外界之光，而是体内真气旺盛、元神焕发的内在表征。但丹经强调，不可执着追求此种景象，见光喜，不见光忧，都是魔障。应视之为过程现象，心不住相，方能进步。

10. 真旨第十 此乃贯穿整个修炼过程的核心要旨和心法。它强调的是“虚无”、“清静”、“自然”。丹法千般口诀，万种操作，其根本指向是让心神回归先天虚无状态，一念不生，万缘放下。只有在这种极致的静定中，先天一气才能得以萌发和长养。一切有为法，如导引、呼吸、意守，最终都是为了进入无为的先天境界。背离了清静无为这个“真旨”，所有功夫都可能落入后天造作，离道愈远。

11. 流珠第十一 “流珠”是对运转周天时，真气（丹头或大药）沿督脉上升、任脉下降这一过程的形象描绘。真气凝聚如珠，圆润光明，在经脉中顺畅运行，如珠走盘，流转不息。这种感觉是气脉通畅、能量充盈的体现。尤其是指“小河车”（气通任督）和“大河车”（气通奇经八脉乃至全身经脉）的能量运行景象，是还丹成果的验证和进一步修炼的基础。

12. 住世第十二 内丹术并非一味追求出世解脱，它首先强调“住世”，即在世间长生驻颜、健康安乐。通过内炼，达到祛病延年、身体强健、精神矍铄的效果，能够更好地生活、行道。所谓“修得命坚，方好栽性根”。拥有一个健康长寿的身体（坚固的鼎炉），才能更好地进行更高层次的心性修炼，乃至最终成就。这是道家“贵生”思想的体现。