治疗第三日，溥仪的热度不降反升，疹点转为脓疱，病情看似加重。穆勒焦急地找到林怀仁：“林先生，病情在恶化，我们必须改用更强力的方法！”

林怀仁却从容不迫：“此乃‘透疹’之象，正是佳兆。温毒外发，故见热势增高；毒化为脓，正是正气驱邪之征。”

他取来《博济医典》，指给穆勒看其中一页：“先师祖在此记载，波斯医师谓天花‘有三关：发热关、出疹关、收靥关’。今皇储正处在出疹转脓的关键时刻，若此时用寒凉强行退热，犹如闭门留寇，反致邪毒内陷。”

穆勒将信将疑，但还是同意再观察一日。

当夜，林怀仁彻夜未眠，守在溥仪榻前。他根据病情变化，随时调整方药：热盛时稍加石膏，气虚时添入太子参。沈墨轩则奉命在研究会随时待命，准备所需药材。

第四日黎明，转机终于出现。溥仪的热度开始下降，脓疱顶部出现凹陷，渐渐结痂。穆勒检查后惊叹：“不可思议！病情真的开始好转了。”

更令人惊喜的是，经过人痘接种，溥仪的天花症状相对较轻，恢复也比预期快得多。

慈禧得知消息，亲至病榻前探望。见溥仪已能进粥，她难得地露出笑容：“林怀仁，你这次又立了大功。”

半月后，溥仪痊愈，只在脸上留下几颗浅浅的麻点。为庆祝皇储康复，宫中特设盛宴。宴席上，慈禧特赐林怀仁和穆勒各人白银千两，锦缎百匹。

然而，林怀仁却婉拒了赏赐：“老臣不敢受赏，只求太后准允一事。”

“讲。”

“老臣恳请将此次治疗天花的经验整理成书，供天下医者参考。若能使万民免受天花之苦，胜于赏赐万千。”

慈禧动容：“准奏。你需要什么，尽管开口。”

于是，在林怀仁的主持下，研究会开始了《痘疹中西汇通篇》的编纂工作。沈墨轩负责整理中医治疗部分，穆勒则撰写西医支持疗法，哈里斯提供了欧洲最新的牛痘接种资料。

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编纂过程中，一个意外的发现让所有人为之振奋：林怀仁改良的人痘法，与欧洲正在推广的牛痘接种法，原理惊人地相似。

“这真是一个奇妙的巧合！”穆勒对比着两种方法的数据，“都是用减毒的病原体激发免疫力。只不过欧洲用牛痘，你们用人痘。”

林怀仁微笑道：“或许这不是巧合。医道相通，正如江河归海。不同的文明，在面对同样的疾病时，找到了相似的对策。”

《痘疹中西汇通篇》成书之日，研究会举行了隆重的发布仪式。书中不仅详细记录了溥仪的治疗全过程，还系统比较了中西医学对天花的不同认识和治法。